タンパク質の高分子量化に伴う広幅化や縮重に対する解決法として、高分子量タンパク質中のメチル基を観測対象としたMethyl-TROSY 法が広く利用されております。このMethyl-TROSY 法では、タンパク質中の特定のメチル基のみを観測可能にするメチル基選択的な安定同位体標識タンパク質を測定サンプルとして使用します。この技術では、安定同位体標識されたアミノ酸前駆体を大腸菌発現系などの培地に添加することにより、アミノ酸生合成経路を利用して系中においてメチル標識イソロイシン、ロイシン、バリンを合成し、これらの合成されたメチル標識アミノ酸がタンパク質合成に利用されることによりメチル選択的安定同位体標識タンパク質試料が調製されます。

最近では化学合成された立体選択的メチル標識バリンやロイシンなどの遊離アミノ酸を各数十mg/L 程度培地に添加することにより、タンパク質中のバリン残基のγ1、γ2あるいはロイシン残基のδ1、δ2のメチル基を立体選択的に標識する技術も開発されました。またアラニン、メチオニン、トレオニンなどのアミノ酸においても同様に、それらのメチル基を安定同位体標識したアミノ酸を用いることにより、これらのアミノ酸残基側鎖のメチル基を同位体標識したタンパク質の調製が可能です。NMR 用の安定同位体標識タンパク質調製技術としては、無細胞タンパク質合成法が大腸菌発現系と並んで広く利用されるようになってきました。